Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NanogQ80Z64 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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