Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc1Q80VQ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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