Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms