Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actr5Q80US4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr5Q80US4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms