Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms