Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pja2Q80U04 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms