Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms