Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY9

Ldoc1, Protein LDOC1, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldoc1Q7TPY9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldoc1Q7TPY9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms