Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShprhQ7TPQ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShprhQ7TPQ3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms