Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ScocQ78YZ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ScocQ78YZ6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ScocQ78YZ6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ScocQ78YZ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms