Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sys1Q78S06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sys1Q78S06 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms