Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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