Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms