Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms