Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms