Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms