Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms