Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms