Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms