Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms