Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtminQ6P9S1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtminQ6P9S1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms