Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms