Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stmnd1Q6P3A1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms