Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casc4Q6P2L7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms