Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms