Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms