Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms