Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms