Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms