Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scaf8Q6DID3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms