Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop58Q6DFW4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms