Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mysm1Q69Z66 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mysm1Q69Z66 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms