Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms