Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms