Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms