Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprdQ64487 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms