Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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