Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms