Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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