Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpd52Q62393 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms