Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt6hQ62383 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms