Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms