Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms