Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms