Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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