Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg2Q61878 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms