Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms