Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga7Q61738 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms