Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi47Q61635 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms