Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms